El Amsacrine es un agente antineoplástico . Su sistema de anillo fundido planar puede intercalar en la DNA de las células del tumor, de tal modo alterando las proporciones principales y de menor importancia del surco. Estas alteraciones a la estructura de la DNA inhiben la réplica y la transcripción de la DNA reduciendo la asociación entre la DNA afectada y: Polimerasa de DNA, polimerasa de ARN y factores de la transcripción.

Amsacrine también expresa la actividad del inhibidor de Topoisomerase, inhibiendo específicamente el topoisomerase II (compara con el más conocido Etoposide del agente).