También en 1936, Anderson y su primer estudiante de tercer ciclo, Seth Neddermeyer, descubrieron el Muon (o el “MU-mesón”, pues era sabido durante muchos años), un que la partícula subatómica 207 mide el tiempo de más masivo que el electrón . Anderson y Neddermeyer al principio creído que habían visto el pión, una partícula que el Hideki Yukawa había postulado en su teoría de la interacción fuerte . Cuando se ponía de manifiesto que qué Anderson había visto era de no el pión, el teórico I. Rabi del físico, desconcertado en cuanto a cómo el descubrimiento inesperado podría caber en cualquier esquema lógico de la física de partícula, pedido famoso el " ¿Quién pidió que ? " (la historia va a veces que él cenaba con los colegas en un restaurante chino en ese entonces). El Muon era el primer de una lista larga de partículas subatómicas cuyo descubrimiento desconcertó inicialmente a teóricos que no podrían hacer el “parque zoológico confuso” cupieron en un cierto esquema conceptual ordenado. El cordero de Willis, en su conferencia 1955 Nobel, bromeó que él había oído que dijo ese " el buscador de una nueva partícula elemental era recompensado por un Premio Nobel, Pero tal descubrimiento ahora se debe castigar por $10."

Carl Anderson pasó toda su carrera en el Caltech . Durante la Segunda Guerra Mundial él condujo la investigación en el Rocketry . Él murió el el 11 de enero, 1991, e interred en el césped del bosque, cementerio de las colinas de Hollywood en el Los Ángeles, California .

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