Un factor (factor del ρ del de rho del ) es una proteína encontrada en los Prokaryotes, especialmente Escherichia Coli del, implicado en la terminación de la transcripción . Esto es hecha por el que disocia el complejo ternario de la transcripción en la terminación de un gene .
Transcripción
La transcripción implica síntesis de una cadena del ARN que representa un filamento de un duplex de la DNA . Por el " representing" significamos que el ARN es idéntico en orden con un filamento de la DNA, que se llama el filamento de codificación del . Es complementaria al otro filamento, que proporciona el filamento de la plantilla del para la síntesis del ARN.La síntesis del ARN es catalizado al lado de la polimerasa de ARN del de la enzima . La transcripción comienza cuando la polimerasa de ARN ata a una región especial, el promotor del, al principio del gene . El promotor rodea el par bajo que es transcritos en el ARN, el punto del primer del comienzo. Desde este punto, la polimerasa de ARN se mueve a lo largo de la plantilla, que sintetiza el ARN del, hasta que alcance una secuencia del adaptador del . Esta acción define una unidad de la transcripción del que extienda del promotor al adaptador .
Una vez que la polimerasa de ARN ha comenzado la transcripción, la enzima se mueve a lo largo de la plantilla, sintetizando el ARN, hasta que resuelva una secuencia del adaptador (t). A este punto, la enzima para el agregar de los nucleótidos a la cadena growing del ARN, lanza el producto terminado, y disocia de la plantilla de la DNA . La terminación requiere que todos los enlaces de hidrógeno que sostienen el híbrido de RNA-DNA juntos deban estar rotos, después de lo cual las reformas del duplex de la DNA.
Los adaptadores varían extensamente en sus eficacias de la terminación. En algunos adaptadores, el acontecimiento de la terminación se puede prevenir por los factores ancilares específicos que obran recíprocamente con la polimerasa de ARN . La antiterminación hace la enzima continuar la transcripción más allá de la secuencia del adaptador, un acontecimiento llamado el readthrough .
Los adaptadores se distinguen en el Escherichia Coli del según si la polimerasa de ARN requiere cualquier factor adicional terminar el in vitro: Una enzima de base del puede terminar el in vitro en ciertos sitios en la ausencia de cualquier otro factor. Estos sitios se llaman los adaptadores intrínsecos . los adaptadores Rho-dependientes son definidos por la necesidad de la adición in vitro factor de rho; y la demostración de las mutaciones que el factor está implicado en el in vivo (mutaciones del de la terminación en un factor de rho puede hacer la polimerasa de ARN leer a partir de un Operon al siguiente, creando moléculas más largas del ARN . Esto es generalmente mortal a la célula pues la producción de exceso del ARN impone una demanda metabólica grande ante la célula).
El factor de rho es una proteína esencial en el Escherichia Coli del . Funciona solamente en la etapa de la terminación. En el Escherichia Coli, del es un hexamer de ~275 kD de las subunidades idénticas . La subunidad tiene un dominio ARN-obligatorio y un dominio de la hidrólisis del ATP del . Rho es un miembro de la familia de helicases hexameric ATP-dependiente que funcionen pasando el ácido nucléico a través del agujero en el medio del hexamer formado de los dominios ARN-obligatorios de las subunidades . Rho funciona como un factor ancilar para la polimerasa de ARN. los adaptadores Rho-dependientes explican sobre los medios adaptadores de Escherichia Coli. Fueron descubiertos en genomas bacteriófagos.
Un factor individual de rho actúa processively en un solo substrato del ARN. La función dominante de rho es su actividad de Helicase, para la cual la energía es proporcionada por una hidrólisis ARN-dependiente del ATP . El punto de enlace inicial para rho es (~70 nucleótidos, a veces 80-100 nucleótidos) una región de una sola fila extendida, rica en la citosina y los pobres en la guanina, en el ARN siendo sintetizado, contracorriente desde la secuencia real del adaptador (se han descubierto muchas tales secuencias. Pero no hay consenso disponible entre éstos, pero las diversas secuencias cada uno parecen específicas, en que los pequeños cambios en la secuencia no causan la terminación). Rho ata al ARN y después utiliza su actividad de la ATpasa para proporcionar la energía al desplaza a lo largo del ARN hasta que alcance la región helicoidal de RNA-DNA, donde desenrolla la estructura a dos caras híbrida. Se piensa que la polimerasa de ARN se detiene brevemente en la secuencia de la terminación que permite que alcance el factor de rho. Sin embargo, la cinética es absolutamente complejo y completamente no se ha analizado ni se ha verificado. Esto a veces se llama el modelo de la búsqueda caliente de la terminación de rho.
Una mutación de absurdo del en un gene de una unidad de la transcripción (aquí, un Operon ; todo el Operons es unidades de la transcripción, pero no viceversa) previene siempre la expresión (traducción ) de los genes subsecuentes en la unidad. Este efecto se llama la polaridad . Una causa común es la ausencia MRNA que corresponde a las partes (distales) subsecuentes de la unidad. Suponer que hay los adaptadores Rho-dependientes dentro de la unidad de la transcripción, es decir, antes del adaptador que se utiliza generalmente. Estos adaptadores anteriores no se utilizan normalmente, porque los ribosomas del evitan que rho alcance la polimerasa de ARN . Pero una mutación de absurdo lanza los ribosomas, de modo que rho esté libre de atar a y/o de moverse a lo largo del ARN, permitiéndole actuar en la polimerasa de ARN en el adaptador. Consecuentemente, se lanza la enzima, y las regiones distales de la unidad de la transcripción nunca se transcriben.
Nota: En los Prokaryotes (como el Escherichia Coli del ), puesto que la DNA es transcrito (ARN de DNA->) y traducido (proteína de RNA->) simultáneamente, el ARN no se refiere generalmente como MRNA . El término mRNA se utiliza en los eucariotas para distinguirlo de otros tipos de ARN y también referir al hecho que el ARN produjo en el núcleo se procesa antes de ser enviado al Cytosol para la traducción .
Ver también
Polimerasa de ARNTranscripción
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