El hibridación DNA-DNA refiere generalmente a una técnica de la biología molecular que mida el grado de semejanza genética entre las piscinas de las secuencias de la DNA . Se utiliza generalmente para determinar la distancia genética entre dos especies . Cuando se comparan varias especies que la manera, los valores de la semejanza permite que la especie sea arreglada en un árbol filogenético ; es por lo tanto un acercamiento posible a la sistemática molecular de realización .
El Charles Sibley y el Jon Ahlquist, pioneros de la técnica, utilizaron el hibridación de DNA-DNA para examinar las relaciones filogenéticas de los avians (la taxonomía de Sibley-Ahlquist) y de los primates. Los críticos sostienen que la técnica es inexacta para la comparación de la especie estrechamente vinculada, como cualquier tentativa de medir diferencias entre las secuencias de Orthologous entre los organismos son abrumados por el hibridación de las secuencias de Paralogous dentro del genoma de un organismo. La secuencia de la DNA y las comparaciones de cómputo de secuencias ahora es generalmente el método para determinar distancia genética, aunque la técnica todavía se utilice en microbiología para ayudar a identificar bacterias.
Método
El método, según lo convertido por Sibley y Ahlquist, compara la fusión de una muestra etiquetada después de que se cruce por hibridación a sí mismo contra su fusión después de cruzado por hibridación a la DNA sin etiqueta de otro organismo. La DNA de las dos especies que se compararán se extrae, purificado y corte en los pedazos cortos (e., 600-800 pares bajos . La DNA de un organismo se etiqueta, después se mezcla con la DNA sin etiqueta que se comparará contra. La mezcla se incuba para permitir que los filamentos de la DNA disocien y reanneal, formando la DNA double-stranded híbrida. Las secuencias cruzadas por hibridación con un alto nivel de semejanza atarán más firmemente, y requieren más energía separarlos: es decir se separan cuando están calentadas en una temperatura más alta que los filamentos disímiles, un proceso conocido como " DNA que derrite el " de ;.Para determinar el perfil de fusión de la DNA cruzada por hibridación, la DNA double-stranded está limitada a una columna y la mezcla se calienta en pequeños pasos. En cada paso, se lava la columna; las secuencias que derriten llegan a ser de una sola fila y se lavan de la columna. Las temperaturas en las cuales etiquetó DNA salen la columna reflejan la cantidad de semejanza entre las secuencias (y la muestra del uno mismo-hibridación sirve como control). Estos resultados se combinan para determinar el grado de semejanza genética entre los organismos.
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