Una ligasa del ubiquitin del (también llamado una ligasa del ubiquitin E3) es una proteína que covalente ata el Ubiquitin a un residuo de la lisina en una proteína de la blanco. La ligasa del ubiquitin está implicada típicamente en el polyubiquitination: un segundo ubiquitin se ata al primer, un tercero se ata al segundo, y así sucesivamente. Polyubiquitination marca las proteínas para la degradación por el Proteasome .
Sin embargo, hay algunos acontecimientos del ubiquitination que se limitan a mono-ubiquitination, en las cuales solamente un solo ubiquitin es agregado por la ligasa del ubiquitiin a una molécula del substrato. Las Mono-ubiquitinated proteínas no se apuntan al Proteasome para la degradación, sino se pueden en lugar de otro alterar en su localización o función celular, por ejemplo vía atar otras proteínas que tengan dominios capaces de atar ubiquitin.
Sistema de Ubiquitination
La ligasa del ubiquitin se refiere como E3 y funciona conjuntamente con una enzima ubiquitin-que activa E1 y una enzima de ubiquitin-conjugación E2. Hay una enzima importante E1, compartida por todas las ligasas del ubiquitin, que utiliza ATP para activar el ubiquitin para la conjugación y lo transfiere a una enzima E2. La enzima E2 obra recíprocamente con un socio específico E3 y transfiere el ubiquitin a la proteína de la blanco. El E3, que puede ser un complejo de la multi-proteína, es generalmente responsable de apuntar el ubiquitination a las proteínas específicas del substrato. Recibe el ubiquitin de la enzima E2 y lo transfiere en algunos casos a la proteína de la blanco; en otros casos actúa obrando recíprocamente con la enzima E2 y el substrato pero nunca sí mismo recibe el ubiquitin.
Familias de la ligasa de Ubiquitin
El complejo Anafase-que promueve (APC) y el SCF complejo (complejo de la proteína de Skp1-Cullin-F-box) son dos ejemplos del andamio de la proteína de la ligasa del ubiquitin implicado en el reconocimiento y el ubiquitination de las proteínas específicas de la blanco para la degradación por el Proteasome .
Cada uno contiene los dominios particulares de la proteína capaces de atar la conjugasa E2, así como un dominio substrato-específico para atar la blanco. Muchos dominios de E2- y el substrato-atar existen. Esta gran variedad se ha descubierto para entrar en los grupos específicos llamados las familias de la ubiquitin-ligasa.
Ejemplos
Un dominio del ANILLO (nuevo gene realmente interesante) ata la conjugasa E2 y pudo mediar actividad enzimática en el complejo E2-E3.Un dominio de la F-caja (como en el complejo de SCF) ata el substrato ubiquitinated. - CDC 4, que ata la proteína Sic1 de la blanco; Grr1, que ata Cln).
Un dominio de HECT - implicado en el tranfer del ubiquitin del E2 al substrato.
Ligasas individuales del ubiquitin E3
E3AMdm2
complejo Anafase-que promueve (APC)
UBR5 (EDD1)
Ver también
ERADUbiquitin
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