Los oligonucleótidos son secuencias cortas de los nucleótidos (ARN o DNA ), típicamente con veinte o pocas bases. Los sintetizadores automatizados permiten la síntesis de oligonucleótidos hasta 160 a 200 bases. La longitud de una base sintetizada es denotada generalmente por el “mer ” (del " de los meros “ griego”; part"). Por ejemplo, un fragmento de 25 bases sería llamado 25 - el mer . Los oligonucleótidos son de uso frecuente como puntas de prueba para detectar la DNA o el ARN complementaria porque atan fácilmente a sus complementos . Los ejemplos de los procedimientos que utilizan los oligonucleótidos son el hibridación in situ fluorescente (PESCADOS) meridional de las manchas blancas /negras de los microarrays de la DNA, y la síntesis de genes artificiales.
Los oligonucleótidos integrados por la DNA (deoxyoligonucleotides) son de uso frecuente en la reacción en cadena de polimerasa (polimerización en cadena), un procedimiento que se pueda emplear para amplificar casi cualquier pedazo de DNA. En este caso, el oligonucleótido se refiere a menudo como una cartilla, o pedazo corto de DNA que ate a su secuencia complementaria de la blanco. Esto genera un lugar para una polimerasa para atar y para ampliar la cartilla por la adición de los nucleótidos para hacer una copia de la secuencia de la blanco.
Los oligonucleótidos se refieren a veces como oligos.
considera también:
la síntesis del oligonucleótido Los oligonucleótidos químicamente se sintetizan usar los nucleótidos, llamados el Phosphoramidites los nucleótidos normales que tienen grupos de la protección: previniendo la amina, grupos de hidróxido y los grupos del fosfato que obran recíprocamente incorrectamente. Un phosphoramidite se agrega en ese entonces, fosfato del producto 5 el ' deprotected, y se agrega una nueva base, y así sucesivamente (al revés); en el extremo, quitan a todos los grupos de la protección. Sin embargo, varias interacciones incorrectas ocurren, llevando a algunos productos defectuosos. Cuanto más larga es la secuencia del oligonucleótido que se está sintetizando, más los defectos allí es; así este proceso es práctico solamente para producir secuencias cortas de nucleótidos. la CLAR se puede utilizar para aislar productos con la secuencia apropiada.
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