En la biología, phylogenetics ( griego del : el phyle del = los genetikos de la tribu, de la raza y del = concerniente a nacimiento, de la génesis del = nacimiento) es el estudio de la conexidad evolutiva entre varios grupos de los organismos (e., especie, poblaciones). También conocido como la sistemática filogenética del o Cladistics, phylogenetics del trata una especie como grupo de individuos linaje-conectados en un cierto plazo. La taxonomía, la clasificación de organismos según semejanza, rico ha sido informada por phylogenetics pero los restos metodológico y lógicamente distinta.

Se mira la evolución como un proceso de ramificación, por el que alteren en un cierto plazo y puedan a las poblaciones Speciate en ramas separadas, cruza por hibridación junto, o termina por la extinción . Éste puede ser visualizado mientras que un carácter-espacio multidimensional que una población mueva con en un cierto plazo. El problema presentó por phylogenetics es que los datos genéticos están solamente disponibles para el presente, y los expedientes del fósil (datos de Osteometric ) es esporádico y menos confiable. Nuestro conocimiento de cómo la evolución funciona se utiliza para reconstruir el árbol lleno.

El Cladistics proporciona un método simplificado de entender árboles filogenéticos. Hay algunos términos que describen la naturaleza de agrupar. Por ejemplo, todos los pájaros y reptiles se creen haber descendido de un solo antepasado común, así que el este agrupar taxonómico (amarillo en el diagrama) se llama el monofilético. " Reptile" moderno; ( ciánico en el diagrama) está agrupando eso contiene a antepasado común, pero no contiene a todos los descendientes de ese antepasado (se excluyen los pájaros). Éste es un ejemplo de un grupo paraphyletic . El agrupar tal como animales de sangre caliente incluiría solamente los mamíferos y los pájaros (rojos/naranja en el diagrama) y se llama el polifilético porque los miembros de esto que agrupa no incluyen a antepasado común más reciente. Aunque sea de sangre caliente los animales todos se desciendan de un antepasado cold-blooded, caliente-bloodedness desarrollado independiente en mamíferos y pájaros.

El la mayoría de los métodos de uso general para deducir filogenias incluye la parsimonia, probabilidad la toda, y el MCMC - inferencia Bayesian basada . el Distancia-basó los árboles de la construcción de los métodos basados en la semejanza total que se asume a menudo para aproximar relaciones filogenéticas. Todos los métodos dependen de un modelo matemático implícito o explícito que describe la evolución de los carácteres observados en la especie incluida, y se utilizan generalmente para la filogenia molecular donde están el nucleótido alineado o secuencias los carácteres del aminoácido .

Teoría de la recapitulación de Ernst Haeckel

Durante el siglo XIX del último, teoría de la recapitulación de s de Haeckel Ernst la ', o la ley biogenética, fue aceptada extensamente. Esta teoría fue expresada a menudo como " La ontogenia recapitula el phylogeny", es decir el desarrollo de un organismo refleja exactamente el desarrollo evolutivo de la especie. La versión temprana de Haeckel de esta hipótesis (que el embrión refleja a antepasados evolutivos del adulto del ) se ha rechazado desde entonces, y la hipótesis se ha enmendado como el desarrollo del embrión que reflejaba los embriones del de sus antepasados evolutivos. La mayoría de los biólogos modernos reconocen conexiones numerosas entre la ontogenia y la filogenia, las explican usar la teoría evolutiva, o las ven como evidencia de apoyo de esa teoría. Williamson cree que las larvas y los embriones representan a adultos en otras taxus que han sido transferidas por el hibridación (la teoría larval de la transferencia)

Transferencia del gene

Los organismos pueden heredar generalmente genes de dos maneras: de padre al descendiente (transferencia vertical del gene), o por la transferencia lateral horizontal o del gene, en la cual los genes saltan entre los organismos sin relación, un fenómeno común en los Prokaryotes

La transferencia lateral del gene ha complicado la determinación de filogenias de organismos puesto que las inconsistencias se han divulgado dependiendo del gene elegido.

Carl Woese subió con la teoría del tres-dominio de la vida (eubacteria, archaea y eucariotas) basada en su descubrimiento que los genes que codifican el ARN ribosomal son antiguos y distribuidos sobre todos los linajes de la vida con poco o nada de transferencia lateral del gene. Por lo tanto el rRNA se recomienda comúnmente como relojes moleculares para reconstruir filogenias.

Esto ha sido particularmente útil para la filogenia de los microorganismos, a los cuales el concepto de la especie no se aplica y que son demasiado morfológico simples ser clasificado basaron en rasgos fenotípicos.

Muestreo de la taxonomía y señal filogenética

Debido al desarrollo de técnicas de secuencia avanzadas en la biología molecular, ha llegado a ser factible recopilar granes cantidades de datos (las secuencias de la DNA o de aminoácido) para estimar filogenias. Por ejemplo, no es raro encontrar estudios con las matrices de carácter basadas en los genomas mitocondriales enteros. Sin embargo, se ha propuesto que es más importante aumentar el número de taxus en la matriz que aumentar el número de carácteres, porque más taxus, más robusta es la filogenia resultante. Esto es en parte debido a la fractura para arriba de las ramas largas . Se ha discutido que esto es una razón importante de incorporar datos de fósiles en filogenias en lo posible. Usar simulaciones, la torre de perforación Zwickl e Hillis encontraron que eso muestreo el aumento de la taxonomía en inferencia filogenética tiene un efecto positivo en la exactitud de análisis filogenéticos.

Otro factor importante que afecta a la exactitud de la reconstrucción del árbol es si los datos analizados contienen realmente la señal filogenética útil, un término que se utilice generalmente para denotar si los organismos relacionados tienden a asemejarse con respecto a su material genético o rasgos fenotípicos.

Ver también

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Zenithic

Phylogenetics

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