El Synaptophysin es una glicoproteína sináptica de la vesícula con cuatro dominios de la transmembrana que pesan el kDa de 38 . Está presente en las células neuroendocrinas y en virtualmente todas las neuronas en el cerebro y la médula espinal que participen en la transmisión sináptica. Actúa como marcador para los tumores neuroendocrinos.

El gene para esta proteína está situado en el cromosoma (Xp11. La función exacta de la proteína es desconocida: obra recíprocamente con el synaptobrevin sináptico esencial de la proteína de la vesícula, pero cuando el gene del synaptophysin se hace inactivo experimental en animales, todavía se convierten y funcionan normalmente.